"Sadece seyahat etmek zorunda olan vatandaşlar aşı olmaya karar verir"

İlk kez Güney Afrika ve Botsvana'da tanımlanan Omicron varyantının hızla yayılması, bir kez daha varyant sürveyansı sorusunu gündeme getiriyor. Sağlık uzmanları, Afrika'daki Covid-19 salgınının durumunu değerlendiriyor.

Afrika'daki salgın durumu nerede? Bugün virüsün dolaşımı hakkında ne biliyoruz?

Dramane Kania: Afrika kıtasındaki durumu diğer kıtalarda gözlemlenenlerle karşılaştırırsak, pandeminin etkisi daha az önemli görünüyor: orada kaydedilen vaka sayısı ve ölüm sayısı daha düşük.

Bununla birlikte, aceleci bir sonuca varmamak gerekir: bu görünüşler muhtemelen yanıltıcıdır ve gerçekte virüsün sirkülasyonu bu rakamların gösterdiğinden kesinlikle daha fazladır. Bu tutarsızlık, Afrika kıtasına özgü sorunlarla açıklanmaktadır: birçok ülkede, aşağıdaki gibi projeler olsa bile tanı kapasiteleri sınırlıdır ve veriler eksiktir. APHRO-VOC ve diğer girişimler birçok ülkede teşhis kapasitesini güçlendirdi. Ayrıca, nüfusun büyük bir kısmı bir sağlık sorunu durumunda mutlaka sağlık kuruluşlarına başvurmak zorunda değildir. Bu nedenlerle, gerçek Covid-19 vakalarının sayısı kesinlikle küçümsenmektedir.

Bu hipotez, daha fazla kaynağa sahip olan ve bu nedenle tanının daha rutin olarak yapılabildiği ülkelerde (Güney Afrika'da veya Mağrip ülkelerinde olduğu gibi) bildirilen vaka sayısının daha önemli olduğu gerçeğiyle desteklenmektedir. Batı Afrika'da ise tam tersine, virüsle enfeksiyondan sonra üretilen antikorları tespit eden seroprevalans çalışmaları ile bir eksik tahminin varlığı doğrulanmıştır. Bu çalışma, bazı yerlerde son aylarda nüfusun yarısından fazlasının SARS-CoV-2'ye maruz kaldığını göstermiştir.

Alfa Keita: 2 Ocak itibariyle Afrika'da 9,5 milyondan fazla vaka vardı ve 230'e yakın ölüm. Bu, diğer kıtalara göre daha az, ancak bir ülkeden diğerine büyük farklılıklar olduğunu görebiliyoruz: Kaydedilen ölümlerin çoğu, en verimli sağlık sistemlerine sahip ve salgınla ilgili verileri doğru bir şekilde toplayabilen ülkelerde. . Bu, vakaların eksik bildirildiği hipotezini desteklemektedir.

Afrika'nın koronavirüsle mücadelede verdiği tepkiye destek veren Ariacov projesi kapsamında, başkent Konakri'nin nüfusundan alınan örnekler üzerinde Gine'de serolojik bir çalışma gerçekleştirdik. Birkaç ay arayla gerçekleştirilen üç anketten oluşan bu çalışma, Aralık 2020'de Konakri nüfusunun %17'sinin virüsle temas halinde olduğunu ortaya koydu. Şubat sonu - Mart başında, bu rakam nüfusun %30'unun üzerine çıktı. Haziran - Temmuz aylarında neredeyse %50'ye ulaştı.

Bu sonuçlar, vaka sayısının hafife alındığını açıkça göstermektedir. Ölüm sayısı da böyle çünkü sadece MUB'a bağlı hastane ve merkezlerde meydana gelenler sayılıyor. Neticede pandemi elbette beklenen katliam değildi ama anlaşılmalıdır ki vaka ve ölüm sayıları küçümsenmiştir.

Richard Njouom: Kamerun'da, Covid-19 salgınının durumu, Sahra altı Afrika'daki diğer ülkelerle aynıdır: Doğrulanmış SARS-CoV-2 enfeksiyonu vakalarının sayısı ve buna bağlı ölümlerin sayısı düşüktür. virüs, muhtemelen bir küçümseme nedeniyle.

Covid-19 pandemisinin etkisini daha iyi anlamak ve SARS-CoV-2'nin Afrika kıtasındaki evrimini takip etmek için 2020 baharında ortak bir araştırma programını başlattık. ONARIMüyesi olan tüm Afrika enstitüleri ile Papaz Ağı. Bu çalışma çeşitli alanları kapsamaktadır: teşhis testlerinin geliştirilmesi ve performans değerlendirmesi (Kamerun'daki Pasteur Center'da, kullanımı kolay bir kolorimetrik test geliştirdik, şu anda sahada ve Pasteur Ağının diğer enstitülerinde değerlendiriliyor.) , virüsün moleküler epidemiyoloji çalışmaları, yayılmasının matematiksel modellemesi, vb. SARS-CoV-2 seroprevalans araştırmaları, sağlık personeli ve kan bağışçıları gibi çeşitli “nöbetçi” popülasyonlarda da yürütülmüştür.

SARS-CoV-2'nin bu dolaşımı, varyantların ortaya çıkmasını teşvik edebilir mi?

TAMAM: Teorinin bize söylediği, bir virüs ne kadar çok dolaşırsa, varyantların ortaya çıkma riskinin o kadar büyük olduğudur. Gerçekten de bir virüs, enfekte olmuş bir hücrede çoğaldığında, genetik materyalini sayısız kez kopyalar. Bunu yaparken de hatalar, mutasyonlar yapabilir. Bu mutasyonlardan bazıları zararlıdır ve onları taşıyan virüsler ölür; diğerleri onarılır; diğerleri hala devam ediyor.

Bütün soru, genomda meydana gelen bu değişikliklerin (ki bu bir bakıma "viral partiküllerin yapı planı", editörün notu) virüsün yapısında değişikliklere yol açıp açmayacağını ve eğer böyleyse, bilmektir. Eğer öyleyse, sonuçlar ne olacak: geçirgenliğini değiştirecekler mi? Virülansı mı? Diğer özellikler?

Bunu tespit edebilmek için, özellikle önemli sıralama kapasitelerine dayanan iyi bir izleme veya gözetim sistemine sahip olmak gereklidir. Ne yazık ki Afrika'da laboratuvarların çoğu gerekli teknik kapasiteye sahip değil. Çoğu durumda, yalnızca virüsün varlığını tespit eden veya yokluğunu onaylayan tanı testlerinin ötesine geçilemez.

Testleri pozitif çıkan örneklerden virüslerin genomunu sıralamak bazen mümkün olsa da, bu sadece ara sıra ve bazen örnek alındıktan sadece 3 veya 4 ay sonra yapılabilir. Gerçek zamanlı değişken izleme yapma kapasitesi çok yetersizdir; bu nedenle, salgının evrimi ve kıtada fiilen dolaşan varyantların sayısı hakkındaki görüşümüz kesinlikle hatalı.

Bu tür bir sürveyans kurabilen ülkeler daha fazla değişken tespit ediyor, bu da muhtemelen Güney Afrika'nın pandeminin başlangıcından bu yana topraklarında en az iki endişe değişkeni tespit ettiği gerçeğini kısmen açıklıyor. Bu, yetkililerin uluslararası toplumu çok erken uyarmalarına izin verdi. Ortağı Bobo Dioulasso'daki Muraz merkezinde dizilemenin öneminin kanıtı.ANRS | Ortaya çıkan bulaşıcı hastalıklarAralık ayı ortasında Omicron varyantı tarafından iki enfeksiyon vakası tespit edebildik, bu da Burkina Faso'da dolaşımda olduğu anlamına geliyor.

Somut olarak, varyantların izlenmesi nasıl gerçekleştirilir?

AK: Esasen ülkelerin dolaşan virüsleri sıralama kapasitesine dayanmaktadır. Şu anda, araştırmacıların elde edilen dizileri (platform gibi) depoladıkları veri tabanlarına yapılan katkılara bakıldığında GISAID örneğin), Afrika'nın çok az katıldığını görüyoruz. Örneğin Gine, 311 Ocak 10'den bu yana GISAID'de yalnızca 2020 genom biriktirdi.

(Aynı dönemde, Güney Afrika yaklaşık 25, Fransa 000, Birleşik Krallık yaklaşık 16 milyon ve ABD 000 milyon yatırdı. Çin bunları yatırdı. 1,5, editörün notu)

Durumu iyileştirmek için proje Afro ekran ANRS tarafından koordine edilerek başlatıldı | Institut Pasteur ve IRD ile işbirliği içinde ortaya çıkan bulaşıcı hastalıklar. Gine'de rutin numune taraması yapmamıza iki ay izin verdi. Bu yaklaşım, pozitif olarak test edilen örneklerde, Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından listelenen bilinen varyantlara karşılık gelen mutasyon profillerine bakmaktan oluşur.

Bu tarama, başkentin üç büyük sağlık merkezinden birinde yatan hastalardan veya kendiliğinden test yaptırmak için gelen kişilerden veya yolculardan alınan numuneler üzerinde gerçekleştirilir. Sonuçlar, gerçek zamanlı izlemeye izin vererek saatler içinde elde edilebilir.

Ancak, mutasyonları zaten tanımlanmış olan, zaten bilinen varyantlara (ilgili varyantlar veya ilgili varyantlar) odaklandığından, taramanın sınırları vardır. Sınıflandırılmamış varyantların mutasyon profillerinin tümü, ek bilgi sağlamayan ve ortaya çıkan varyantların kapsamlı bir şekilde izlenmesine izin vermeyen "vahşi" olarak listelenmiştir.

Yalnızca tüm genom dizilimi, yeni varyantlarda meydana gelebilecek mutasyonların ayrıntılı bir analizine izin verebilir ve bunların endişe yaratıp yaratmayacağını, virüsü daha bulaşıcı hale getirip getirmeyeceğine veya kaçmasına izin vereceklerine dair herhangi bir endişe olup olmadığını belirleyebilir. bağışıklık - ister doğal ister aşılarla vs.

Bu nedenle, aynı zamanda Afroscreen ağının da konusu olan bu kapasiteleri mümkün olduğunca çok ülkede güçlendirmek (özellikle bir ülkeden diğerine verileri karşılaştırabilmek için) gereklidir.

RN: SARS-CoV-2'nin zaman ve uzayda yayılmasını incelemek ve tehlikeli varyantların ortaya çıkışını izlemek için dizileme gerçekten çok önemlidir. Kamerun'da Pasteur Enstitüsü'nün desteği sayesinde hem malzeme hem de personel eğitimi açısından kapasitemizi güçlendirmeyi başardık. Ocak 2021 itibariyle, 116 tam genomun dizilenmesiyle sonuçlanan genomik izlemeyi kurabildik. Elde edilen sonuçlar Alpha, Beta, Delta ve Gamma varyantlarının ülkedeki dolaşımını doğruladı. Afroscreen ağının bu çabayı on katına çıkaracağını umuyoruz.

13 Afrika ülkesini bir araya getiren bu büyüklükte bir ağın parçası olmanın bir diğer avantajı da bilgi ve veri paylaşımı. Elde edilen sonuçların açık veri tabanı GISAID'de yayınlanması ile bölgedeki trafiğin izlenmesi ve daha iyi anlaşılması mümkün olacaktır.

Aşı konusunda kıtanın neresindeyiz?

TAMAM: Birçok ülke başlangıçta aşıyı elde etmede zorluklarla karşılaştı. Sorunun üstesinden gelmek için, çeşitli girişimler ortaya çıktı. Kesinlikle gerekli olan bu erişilebilirlik sorununun ötesinde, ikinci bir sorun ortaya çıkıyor: genellikle sorularına cevap verecek bilimsel bilgiye sahip olmayan nüfusların desteği. Sahte haberler ise sosyal ağlarda geniş çapta yayılıyor ve insanların aşı konusundaki güvensizliğini besliyor. Şu anda sadece seyahat etmek zorunda olan vatandaşlar aşı olmaya karar veriyor gibi görünüyor… Bu eğilimi tersine çevirmek başka bir zorluk.

RN: Kamerun'da aşılama durumu çok geç: hedef nüfusun sadece %1.1'i eksiksiz bir aşı takvimine sahip. İnsanlar ülkede mevcut olan aşılardan şüpheleniyorlar. Bu nedenle zorluklardan biri, insanları aşıların geçerliliğine ikna etmektir. Afrika'da gözlemlenen bu aşı gecikmesi, dizileme yoluyla varyantların gözetiminin daha da güçlendirilmesini gerektirmektedir. Hangi varyantların hangi bölgelerde dolaştığını belirleyebilirsek, sağlık yetkililerinin salgını kontrol altına almada daha etkili olan hedefli aşı kampanyaları oluşturmaya karar vermesi daha kolay olacaktır.

---

Alfa Kabinet Keita, Mikrobiyolog, Conakry Üniversitesi'nde yardımcı doçent, Montpellier Üniversitesi'nde araştırmacı, Inserm U1175, Bu kurumda kurumsallaşma (IRD); Drama Kania, Eczacı-Virolog, MURAZ Merkezi (Bobo-Dioulasso, Burkina Faso) - Ulusal Halk Sağlığı Enstitüsü ve Richard Njouom, Kamerun'daki Pasteur Merkezi'nin viroloji bölümü başkanı, Kamerun Pasteur Merkezi

Bu makale şuradan yeniden yayınlandı: Konuşma Creative Commons lisansı altında. Okumakorijinal makale.