Die rasche Verbreitung der erstmals in Südafrika und Botswana identifizierten Omicron-Variante wirft erneut die Frage nach der Variantenüberwachung auf. Gesundheitsexperten ziehen Bilanz zur Lage der Covid-19-Epidemie in Afrika.
Wo ist die epidemische Situation in Afrika? Was wissen wir heute über die Verbreitung des Virus?
Dramane Kania: Vergleicht man die Situation auf dem afrikanischen Kontinent mit der auf anderen Kontinenten, erscheinen die Auswirkungen der Pandemie weniger wichtig: Die dort registrierten Fallzahlen sind geringer, ebenso die Zahl der Toten.
Allerdings sollte man keine vorschnellen Schlüsse ziehen: Diese Anscheine sind wahrscheinlich irreführend, und in Wirklichkeit ist die Verbreitung des Virus sicherlich größer, als diese Zahlen vermuten lassen. Diese Diskrepanz wird durch spezifische Probleme des afrikanischen Kontinents erklärt: In vielen Ländern sind die diagnostischen Kapazitäten begrenzt und es fehlen Daten, auch wenn Projekte wie APHRO-VOC und andere Initiativen haben die diagnostischen Kapazitäten in mehreren Ländern gestärkt. Zudem ist ein Großteil der Bevölkerung es nicht unbedingt gewohnt, bei gesundheitlichen Problemen auf Gesundheitsstrukturen zu verweisen. Aus diesen Gründen wird die Zahl der realen Fälle von Covid-19 daher mit Sicherheit unterschätzt.
Diese Hypothese wird dadurch bestätigt, dass in Ländern, die über mehr Ressourcen verfügen und die Diagnose daher routinemäßiger gestellt werden kann (wie in Südafrika oder in den Maghreb-Staaten), die Zahl der gemeldeten Fälle wichtiger ist. In Westafrika hingegen wurde die Existenz einer Unterschätzung durch Seroprävalenzstudien bestätigt, die die nach einer Infektion mit dem Virus gebildeten Antikörper nachweisen. Diese Arbeit hat gezeigt, dass in den letzten Monaten mancherorts mehr als die Hälfte der Bevölkerung SARS-CoV-2 ausgesetzt war.
Alpha Keita: Am 2. Januar gab es in Afrika mehr als 9,5 Millionen Fälle und fast 230 Tote. Dies ist weniger als auf anderen Kontinenten, aber wir können sehen, dass es von Land zu Land große Unterschiede gibt: Die meisten der registrierten Todesfälle sind in Ländern mit den effizientesten Gesundheitssystemen zu verzeichnen, die in der Lage sind, Daten zur Epidemie korrekt zu sammeln . Dies unterstützt die Hypothese einer unzureichenden Erfassung von Fällen.
Im Rahmen des Ariacov-Projekts, das die afrikanische Reaktion im Kampf gegen das Coronavirus unterstützte, haben wir in Guinea eine serologische Studie an Proben aus der Bevölkerung der Hauptstadt Conakry durchgeführt. Diese Arbeit, die aus drei Umfragen bestand, die im Abstand von einigen Monaten durchgeführt wurden, ergab, dass im Dezember 2020 17% der Bevölkerung von Conakry mit dem Virus in Kontakt gekommen waren. Ende Februar – Anfang März war diese Zahl auf über 30 % der Bevölkerung gestiegen. Im Juni - Juli erreichte sie fast 50%.
Diese Ergebnisse zeigen deutlich, dass die Fallzahlen unterschätzt werden. Auch die Zahl der Todesfälle stimmt, denn es werden nur solche gezählt, die in den der CHU angeschlossenen Spitälern und Zentren eintreten. Letztendlich war die Pandemie natürlich nicht das erwartete Gemetzel, aber es sollte verstanden werden, dass die Zahl der Fälle und Todesfälle unterschätzt wurde.
Richard Njouom: In Kamerun ist die Situation der Covid-19-Epidemie identisch mit der in anderen Ländern in Subsahara-Afrika: Die Zahl der bestätigten Fälle von SARS-CoV-2-Infektionen ist gering, ebenso die Zahl der Todesfälle, die auf die Virus, möglicherweise aufgrund einer Unterschätzung.
Um die Auswirkungen der Covid-19-Pandemie besser zu verstehen und die Entwicklung von SARS-CoV-2 auf dem afrikanischen Kontinent zu verfolgen, haben wir im Frühjahr 2020 ein gemeinsames Forschungsprogramm namens . ins Leben gerufen REPARIEREN, mit allen afrikanischen Instituten, die Mitglieder des Pastorennetzwerk. Diese Arbeit umfasst verschiedene Bereiche: Entwicklung und Leistungsbewertung diagnostischer Tests (im Pasteur Center in Kamerun haben wir einen einfach zu bedienenden kolorimetrischen Test entwickelt, der derzeit im Feld und in den anderen Instituten des Pasteur-Netzwerks evaluiert wird. ) , molekulare epidemiologische Studien des Virus, mathematische Modellierung seiner Verbreitung usw. SARS-CoV-2-Seroprävalenzerhebungen wurden auch bei mehreren „Wächter“-Populationen wie Gesundheitspersonal und Blutspendern durchgeführt.
Kann diese Zirkulation von SARS-CoV-2 die Entstehung von Varianten begünstigen?
DK: Die Theorie besagt, dass je mehr ein Virus zirkuliert, desto größer ist das Risiko der Entstehung von Varianten. Wenn sich ein Virus in einer infizierten Zelle vermehrt, kopiert es sein genetisches Material unzählige Male. Dabei kann er Fehler machen, Mutationen. Einige dieser Mutationen sind schädlich, und die Viren, die sie tragen, sterben ab; andere werden repariert; andere bestehen noch.
Die ganze Frage ist, ob diese Veränderungen im Genom (das ist gewissermaßen der "Bauplan von Viruspartikeln", Anm. d. Red.) zu Veränderungen in der Struktur des Virus führen und ob dies der Fall ist. Wenn ja, was sind die Konsequenzen: Wird die Übertragbarkeit geändert? Seine Virulenz? Andere Eigenschaften?
Um dies erkennen zu können, bedarf es eines guten Monitoring- bzw. Surveillance-Systems, insbesondere basierend auf erheblichen Sequenzierungskapazitäten. Leider verfügen die meisten Labore in Afrika nicht über die erforderliche technische Kapazität. In den meisten Fällen kann man nicht über diagnostische Tests hinausgehen, die nur das Vorhandensein des Virus erkennen oder seine Abwesenheit bestätigen.
Während es manchmal möglich ist, das Genom von Viren aus positiv getesteten Proben zu sequenzieren, ist dies nur gelegentlich und manchmal nur 3 oder 4 Monate nach der Probenentnahme möglich. Die Kapazität für die Variantenüberwachung in Echtzeit ist sehr unzureichend; Aus diesem Grund ist unsere Ansicht über die Entwicklung der Epidemie und die Anzahl der tatsächlich auf dem Kontinent zirkulierenden Varianten sicherlich falsch.
Länder, die diese Art der Überwachung einrichten können, entdecken mehr Varianten, was wahrscheinlich zum Teil die Tatsache erklärt, dass Südafrika seit Beginn der Pandemie mindestens zwei besorgniserregende Varianten in seinem Hoheitsgebiet identifiziert hat. Dadurch konnten die Behörden die internationale Gemeinschaft sehr früh alarmieren. Beweis für die Bedeutung der Sequenzierung im Muraz-Zentrum in Bobo Dioulasso, Partner desANRS | Neu auftretende Infektionskrankheitenkonnten wir Mitte Dezember zwei Fälle von Infektionen durch die Omicron-Variante nachweisen, wodurch sie auch in Burkina Faso im Umlauf ist.
Wie erfolgt konkret das Monitoring von Varianten?
AK: Sie basiert im Wesentlichen auf der Fähigkeit der Länder, zirkulierende Viren zu sequenzieren. Betrachtet man derzeit die Beiträge zu den Datenbanken, in denen die Forscher die erhaltenen Sequenzen hinterlegen (wie die Plattform GISID zum Beispiel), sehen wir, dass Afrika sich sehr wenig beteiligt. Guinea beispielsweise hat seit dem 311. Januar 10 erst 2020 Genome auf GISAID hinterlegt.
(Im gleichen Zeitraum hinterlegte Südafrika fast 25, Frankreich 000, das Vereinigte Königreich fast 16 Millionen und die Vereinigten Staaten 000 Millionen. China hinterlegte sie. 1,5, Anm. d. Red.)
Um die Situation zu verbessern, wird das Projekt Afroscreen wurde ins Leben gerufen, koordiniert von ANRS | Neu auftretende Infektionskrankheiten, in Zusammenarbeit mit dem Institut Pasteur und dem IRD. In Guinea hat es uns zwei Monate lang ermöglicht, routinemäßiges Probenscreening zu praktizieren. Dieser Ansatz besteht darin, in positiv getesteten Proben nach den Mutationsprofilen zu suchen, die den bekannten Varianten entsprechen, die von der Weltgesundheitsorganisation (WHO) aufgelistet sind.
Dieses Screening wird an Proben durchgeführt, die entweder von Patienten, die in einem der drei großen Gesundheitszentren der Hauptstadt ins Krankenhaus eingeliefert wurden, oder von Personen, die spontan zu einem Test kommen, oder von Reisenden entnommen wurden. Ergebnisse können innerhalb von Stunden erhalten werden, was eine Echtzeitüberwachung ermöglicht.
Das Screening hat jedoch seine Grenzen, da es sich auf bereits bekannte Varianten (interessante oder besorgniserregende Varianten) konzentriert, deren Mutationen bereits identifiziert wurden. Die Mutationsprofile der nicht klassifizierten Varianten sind alle als „wild“ aufgeführt, was keine zusätzlichen Informationen liefert und keine erschöpfende Überwachung der auftretenden Varianten erlaubt.
Nur die Sequenzierung des gesamten Genoms kann eine detaillierte Analyse der Mutationen ermöglichen, die in den neuen Varianten auftreten können, und feststellen, ob sie besorgniserregend sind oder nicht, ob es Bedenken gibt, dass sie das Virus übertragbarer machen oder entweichen lassen Immunität - ob natürlich oder durch Impfstoffe usw.
Daher ist es notwendig, diese Kapazitäten in möglichst vielen Ländern zu stärken (insbesondere um Daten von einem Land zum anderen vergleichen zu können), was auch Gegenstand des Afroscreen-Netzwerks ist.
RN: Die Sequenzierung ist in der Tat unerlässlich, um die Verbreitung von SARS-CoV-2 in Zeit und Raum zu untersuchen und das Auftreten gefährlicher Varianten zu verfolgen. In Kamerun konnten wir dank der Unterstützung des Instituts Pasteur unsere Kapazitäten sowohl bei der Material- als auch bei der Personalausbildung stärken. So konnten wir ab Januar 2021 ein Genom-Monitoring aufbauen, das zur Sequenzierung von 116 vollständigen Genomen führte. Die erhaltenen Ergebnisse bestätigten die Verbreitung der Alpha-, Beta-, Delta- und Gamma-Varianten im Land. Wir hoffen, dass das Afroscreen-Netzwerk diesen Aufwand verzehnfacht.
Ein weiterer Vorteil der Zugehörigkeit zu einem Netzwerk dieser Größe, das 13 afrikanische Länder vereint, ist der Austausch von Wissen und Daten. Durch die Veröffentlichung der erhaltenen Ergebnisse in der offenen Datenbank GISAID wird es möglich sein, den Verkehr in der Region zu überwachen und besser zu verstehen.
Was die Impfung betrifft, wo stehen wir auf dem Kontinent?
DK: Viele Länder hatten anfangs Schwierigkeiten, den Impfstoff zu erhalten. Um das Problem zu lösen, verschiedene Initiativen sind entstanden. Über diese sicherlich wesentliche Frage der Zugänglichkeit hinaus stellt sich ein zweites Problem: die der Unterstützung der Bevölkerung, der in der Regel wissenschaftliche Informationen fehlen, um ihre Fragen zu beantworten. Fake News hingegen werden in sozialen Netzwerken verbreitet und nähren das Misstrauen der Menschen gegenüber Impfungen. Im Moment scheint es, als würden sich nur reisepflichtige Bürger impfen lassen… Diesen Trend umzukehren, ist eine weitere Herausforderung.
RN: In Kamerun ist die Impfsituation sehr spät: Nur 1.1 % der Zielbevölkerung verfügt über einen vollständigen Impfplan. Die Menschen sind misstrauisch gegenüber den im Land verfügbaren Impfstoffen. Eine der Herausforderungen besteht daher darin, die Menschen von der Gültigkeit von Impfstoffen zu überzeugen. Diese in Afrika beobachtete Impfverzögerung erfordert eine noch stärkere Überwachung von Varianten durch Sequenzierung. Wenn wir feststellen können, welche Varianten in welchen Gebieten zirkulieren, könnten die Gesundheitsbehörden leichter entscheiden, gezielte Impfkampagnen durchzuführen, die die Epidemie wirksamer eindämmen.
Alpha-Kabinett Keita, Mikrobiologe, Assistenzprofessor an der Universität Conakry, Forscher an der Universität Montpellier, Inserm U1175, Institut für Entwicklungsforschung (IRD); Dramane Kania, Apotheker-Virologe, Zentrum MURAZ (Bobo-Dioulasso, Burkina Faso) - Nationales Institut für öffentliche Gesundheit, und Richard Njoom, Leiter der Virologieabteilung des Centre Pasteur in Kamerun, Kamerun Pasteur Zentrum
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