يثير الانتشار السريع لمتغير Omicron ، الذي تم تحديده لأول مرة في جنوب إفريقيا وبوتسوانا ، مرة أخرى مسألة المراقبة المتغيرة. يقوم أخصائيو الصحة بتقييم حالة وباء Covid-19 في إفريقيا.
أين وضع الوباء في إفريقيا؟ ماذا نعرف عن تداول الفيروس اليوم؟
درامان كانيا: إذا قارنا الوضع في القارة الأفريقية بتلك الملحوظة في القارات الأخرى ، فإن تأثير الوباء يبدو أقل أهمية: عدد الحالات المسجلة هناك أقل ، وكذلك عدد الوفيات.
ومع ذلك ، لا ينبغي للمرء أن يقفز إلى استنتاج متسرع: ربما تكون هذه المظاهر مضللة ، وفي الواقع ، فإن انتشار الفيروس بالتأكيد أكبر مما تشير إليه هذه الأرقام. يفسر هذا التناقض من خلال القضايا الخاصة بالقارة الأفريقية: في العديد من البلدان ، تكون القدرات التشخيصية محدودة والبيانات غير متوفرة ، حتى لو كانت مشاريع مثل أفرو كوف ومبادرات أخرى عززت القدرة التشخيصية في العديد من البلدان. بالإضافة إلى ذلك ، لا يستخدم جزء كبير من السكان بالضرورة للإشارة إلى هياكل الرعاية الصحية في حالة حدوث مشكلة صحية. لهذه الأسباب ، فإن عدد الحالات الحقيقية لـ Covid-19 أقل من الواقع بالتأكيد.
يتم دعم هذه الفرضية من خلال حقيقة أنه في البلدان التي لديها موارد أكثر وحيث يمكن إجراء التشخيص بشكل أكثر روتينية (كما هو الحال في جنوب إفريقيا أو في دول المغرب العربي) ، يكون عدد الحالات المبلغ عنها أكثر أهمية. في غرب إفريقيا ، على العكس من ذلك ، تم تأكيد وجود التقليل من خلال دراسات الانتشار المصلي ، التي تكشف عن الأجسام المضادة المنتجة بعد الإصابة بالفيروس. أظهر هذا العمل أنه في بعض الأماكن تعرض أكثر من نصف السكان لـ SARS-CoV-2 في الأشهر الأخيرة.
ألفا كيتا: اعتبارًا من 2 يناير في إفريقيا ، كان هناك أكثر من 9,5 مليون حالة و ما يقرب من 230،000 حالة وفاة. هذا أقل مما هو عليه في القارات الأخرى ، لكن يمكننا أن نرى أن هناك فوارق كبيرة من بلد إلى آخر: معظم الوفيات المسجلة في البلدان التي لديها أنظمة صحية أكثر كفاءة ، والقادرة على جمع البيانات المتعلقة بالوباء بشكل صحيح . هذا يدعم فرضية نقص الإبلاغ عن الحالات.
كجزء من مشروع أرياكوف ، الذي دعم الاستجابة الأفريقية في مكافحة فيروس كورونا ، أجرينا دراسة مصلية في غينيا على عينات مأخوذة من سكان العاصمة كوناكري. أظهر هذا العمل ، الذي يتكون من ثلاثة استطلاعات أجريت قبل بضعة أشهر ، أنه في ديسمبر 2020 ، كان 17 ٪ من سكان كوناكري على اتصال بالفيروس. بحلول نهاية فبراير - بداية مارس ، ارتفع هذا الرقم إلى أكثر من 30 ٪ من السكان. في حزيران (يونيو) - تموز (يوليو) وصلت النسبة إلى ما يقارب 50٪.
تشير هذه النتائج بوضوح إلى الاستهانة بعدد الحالات. عدد الوفيات كذلك ، لأنه يتم احتساب فقط تلك التي تحدث في المستشفيات والمراكز التابعة لـ CHU. في النهاية ، بالطبع ، لم يكن الوباء هو الذبح المتوقع ، لكن يجب أن يكون مفهوماً أن عدد الحالات والوفيات قد تم التقليل من شأنها.
ريتشارد نجوم: في الكاميرون ، يتطابق وضع وباء Covid-19 مع حالة البلدان الأخرى في إفريقيا جنوب الصحراء الكبرى: عدد الحالات المؤكدة للإصابة بفيروس SARS-CoV-2 منخفض ، وكذلك عدد الوفيات التي تُعزى إلى الفيروس ، ربما بسبب الاستهانة.
من أجل فهم تأثير جائحة Covid-19 بشكل أفضل ومتابعة تطور SARS-CoV-2 في القارة الأفريقية ، أطلقنا في ربيع عام 2020 برنامج بحث تعاوني يسمى يصلح، مع جميع المعاهد الأفريقية الأعضاء في شبكة القس. يغطي هذا العمل مجالات مختلفة: تطوير وتقييم أداء الاختبارات التشخيصية (في مركز باستير في الكاميرون ، قمنا بتطوير اختبار قياس لوني سهل الاستخدام ، يجري تقييمه حاليًا في الميدان وفي المعاهد الأخرى التابعة لشبكة باستير.) ، والدراسات الوبائية الجزيئية للفيروس ، والنمذجة الرياضية لانتشاره ، وما إلى ذلك. كما تم إجراء مسوحات الانتشار المصلي لـ SARS-CoV-2 ضمن العديد من المجموعات السكانية "الخافرة" ، مثل العاملين الصحيين والمتبرعين بالدم.
هل يمكن أن يؤدي تداول SARS-CoV-2 إلى تعزيز ظهور المتغيرات؟
DK: ما تخبرنا به النظرية هو أنه كلما زاد انتشار الفيروس ، زاد خطر ظهور المتغيرات. في الواقع ، عندما يتكاثر الفيروس في خلية مصابة ، فإنه ينسخ مادته الجينية مرات لا تحصى. بفعله هذا ، يمكنه أن يرتكب أخطاء ، طفرات. بعض هذه الطفرات ضارة والفيروسات التي تحملها تموت. يتم إصلاح البعض الآخر. البعض الآخر لا يزال قائما.
السؤال برمته هو ما إذا كانت هذه التغييرات التي تحدث في الجينوم (وهي بطريقة ما "خطة بناء الجزيئات الفيروسية" ، ملاحظة المحرر) ستؤدي إلى تغييرات في بنية الفيروس ، وإذا كان الأمر كذلك. إذا كان الأمر كذلك. ، ما هي العواقب: هل سيعدلون قابليته للانتقال؟ ضراوتها؟ مميزات وخصائص اخرى؟
لتتمكن من اكتشاف ذلك ، من الضروري أن يكون لديك نظام مراقبة أو مراقبة جيد ، يعتمد بشكل خاص على قدرات التسلسل المهمة. لسوء الحظ ، لا تمتلك غالبية المختبرات في إفريقيا القدرة التقنية المطلوبة. في معظم الحالات ، لا يمكن للمرء أن يتجاوز الاختبارات التشخيصية ، التي تكتفي فقط بالكشف عن وجود الفيروس أو تأكيد عدم وجوده.
في حين أنه من الممكن في بعض الأحيان تسلسل جينوم الفيروسات من العينات التي أثبتت نتائجها إيجابية ، إلا أنه لا يمكن القيام بذلك إلا في بعض الأحيان ، وأحيانًا بعد 3 أو 4 أشهر فقط من جمع العينة. القدرة على القيام برصد المتغير في الوقت الحقيقي غير كافية للغاية ؛ لهذا السبب ، فإن نظرتنا لتطور الوباء وعدد المتغيرات المنتشرة فعليًا في القارة معيبة بالتأكيد.
تكتشف البلدان القادرة على إنشاء هذا النوع من المراقبة المزيد من المتغيرات ، والتي ربما تكون جزءًا من السبب الذي دفع جنوب إفريقيا إلى تحديد نوعين مختلفين على الأقل من المتغيرات في أراضيها منذ بداية الوباء. سمح ذلك للسلطات بتنبيه المجتمع الدولي في وقت مبكر جدًا. دليل على أهمية التسلسل ، في مركز Muraz في Bobo Dioulasso ، شريكANRS | ظهور الأمراض المعدية، تمكنا في منتصف ديسمبر من اكتشاف حالتين من الإصابات بواسطة متغير Omicron ، مما يعني أنه ينتشر أيضًا في بوركينا فاسو.
بشكل ملموس ، كيف يتم مراقبة المتغيرات؟
AK: يعتمد بشكل أساسي على قدرة البلدان على تسلسل الفيروسات المنتشرة. في الوقت الحالي ، عند النظر في المساهمات في قواعد البيانات التي يودع فيها الباحثون التسلسلات التي تم الحصول عليها (مثل المنصة جيسيد على سبيل المثال) ، نرى أن مشاركة إفريقيا قليلة جدًا. غينيا ، على سبيل المثال ، أودعت 311 جينومًا فقط على GISAID منذ 10 يناير 2020.
(خلال نفس الفترة ، أودعت جنوب إفريقيا ما يقرب من 25 ، وفرنسا 000 ، والمملكة المتحدة ما يقرب من 16 مليون ، والولايات المتحدة 000 مليون. وأودعتهم الصين. 1,5 ، ملاحظة المحرر)
لتحسين الوضع ، المشروع أفروسكرين بالتنسيق مع ANRS | ظهور الأمراض المعدية بالتعاون مع معهد باستير و IRD. في غينيا ، سمح لنا لمدة شهرين بممارسة فحص العينات الروتيني. يتكون هذا النهج من البحث ، في العينات التي تم اختبارها إيجابية ، لمحات الطفرات المقابلة للمتغيرات المعروفة ، المدرجة من قبل منظمة الصحة العالمية (WHO).
يتم إجراء هذا الفحص على عينات مأخوذة إما من المرضى الموجودين في المستشفى في أحد المراكز الصحية الرئيسية الثلاثة في العاصمة ، أو من الأشخاص الذين يأتون تلقائيًا للفحص ، أو من المسافرين. يمكن الحصول على النتائج في غضون ساعات ، مما يسمح بالمراقبة في الوقت الفعلي.
لكن الفحص له حدوده ، لأنه يركز على المتغيرات المعروفة بالفعل (المتغيرات ذات الاهتمام أو المتغيرات المثيرة للقلق) ، والتي تم تحديد الطفرات فيها بالفعل. يتم سرد جميع ملفات تعريف الطفرات للمتغيرات غير المصنفة على أنها "برية" ، والتي لا توفر معلومات إضافية ولا تسمح بالمراقبة الشاملة للمتغيرات التي تظهر.
يمكن فقط لتسلسل الجينوم الكامل أن يسمح بتحليل مفصل للطفرات التي قد تحدث في المتغيرات الجديدة ، وتحديد ما إذا كانت مثيرة للقلق أم لا ، وما إذا كان هناك أي قلق من أنها ستجعل الفيروس أكثر قابلية للانتقال ، أو تسمح له بالهروب المناعة - سواء كانت طبيعية أو ممنوحة عن طريق اللقاحات ، إلخ.
لذلك من الضروري تعزيز هذه القدرات في أكبر عدد ممكن من البلدان (على وجه الخصوص لتكون قادرًا على مقارنة البيانات من بلد إلى آخر) ، وهو أيضًا موضوع شبكة Afroscreen.
آكانيوز: يعد التسلسل ضروريًا بالفعل لدراسة انتشار SARS-CoV-2 في الزمان والمكان وتتبع ظهور المتغيرات الخطرة. في الكاميرون ، بفضل دعم معهد باستير ، تمكنا من تعزيز قدراتنا ، سواء من حيث المواد أو تدريب الموظفين. اعتبارًا من يناير 2021 ، تمكنا من إعداد مراقبة الجينوم التي أدت إلى تسلسل 116 جينومًا كاملاً. أكدت النتائج التي تم الحصول عليها تداول متغيرات Alpha و Beta و Delta و Gamma في البلاد. نأمل أن تزيد شبكة Afroscreen من هذا الجهد عشرة أضعاف.
الميزة الأخرى لكونك جزءًا من شبكة بهذا الحجم ، والتي تضم 13 دولة أفريقية ، هي تبادل المعرفة والبيانات. من خلال نشر النتائج التي تم الحصول عليها في قاعدة بيانات GISAID المفتوحة ، سيكون من الممكن مراقبة وفهم حركة المرور في المنطقة بشكل أفضل.
بخصوص التطعيم أين نحن في القارة؟
DK: واجهت العديد من البلدان في البداية صعوبات في الحصول على اللقاح. للتغلب على المشكلة ، ظهرت مبادرات مختلفة. بالإضافة إلى مسألة إمكانية الوصول هذه ، والتي تعتبر ضرورية بالتأكيد ، تظهر مشكلة ثانية: مشكلة دعم السكان ، الذين يفتقرون عمومًا إلى المعلومات العلمية للإجابة على أسئلتهم. من ناحية أخرى ، يتم نقل الأخبار الكاذبة على نطاق واسع على الشبكات الاجتماعية ، وتغذي عدم ثقة الناس في التطعيم. في الوقت الحالي ، يبدو أن المواطنين الملزمين بالسفر هم وحدهم العزمون على التطعيم ... عكس هذا الاتجاه هو تحدٍ آخر.
آكانيوز: في الكاميرون ، وضع التطعيم متأخر جدًا: 1.1٪ فقط من السكان المستهدفين لديهم جدول تطعيم كامل. يشك الناس في اللقاحات المتوفرة في البلاد. ولذلك فإن أحد التحديات هو إقناع الناس بصحة اللقاحات. هذا التأخير في اللقاح الذي لوحظ في إفريقيا يستدعي المزيد من تعزيز مراقبة المتغيرات عن طريق التسلسل. إذا تمكنا من تحديد المتغيرات التي يتم تداولها في أي مناطق ، فسيكون من الأسهل على السلطات الصحية أن تقرر إنشاء حملات تلقيح مستهدفة ، تكون أكثر فعالية في احتواء الوباء.
ألفا كابينت كيتا، عالم ميكروبيولوجي ، أستاذ مساعد بجامعة كوناكري ، باحث بجامعة مونبلييه ، Inserm U1175 ، معهد البحوث من أجل التنمية (IRD); درامان كانيا، صيدلي-عالم فيروسات ، مركز موراز (بوبو ديولاسو ، بوركينا فاسو) - المعهد الوطني للصحة العامة ، و ريتشارد نجوم، رئيس قسم علم الفيروسات في مركز باستور في الكاميرون ، مركز الكاميرون باستور
تم إعادة نشر هذه المقالة من المحادثة بموجب رخصة المشاع الإبداعي. إقرأ الالمادة الأصلية.